Siswa sekolah menengah Homura Suzuko telah kembali ke Ikebukuro, kota tempat dia dibesarkan. ‘Kita berteman selamanya!’ Dia menyimpan kenangannya tentang teman lamanya sejak masih kecil, Morikawa Chinatsu, dan dia senang bertemu lagi dengannya. Tetapi ketika dia sampai di sekolah, dia menemukan bahwa dia memiliki kesulitan menyesuaikan diri dengan anggota kelas yang lain. Suatu hari, dia memutuskan bahwa jika dia belajar bermain permainan kartu WIXOSS, dia mungkin bisa mendapatkan beberapa teman. Dia berhenti di sebuah toko kartu dalam perjalanan pulang dan membeli set dek. Ketika dia membawa set itu pulang dan membukanya, gadis di salah satu kartu mulai bergerak, dan berbicara. ‘Selamat datang, Selector.’ Manusia yang dipilih sebagai penyeleksi harus berjuang untuk mengendalikan lima koin yang menyimpan semua ingatan mereka. Jika mereka dapat merebut kembali semua koin, mereka menang, dan dapat meninggalkan permainan. Tetapi jika mereka kalah, sebagai penalti